L’une des avancées majeures de la Constitution sur l'Europe réside dans la clarification du fonctionnement institutionnel de l’Union européenne. Le caractère complexe de la "machine communautaire" a trop souvent été à l’origine du désintérêt des citoyens pour les décisions prises par l’Europe, jugées trop lointaines. C’est pour rendre le système politique européen lisible par les citoyens que la Constitution précise le rôle et les fonctions de chacune des institutions.
Pour permettre à l’Union, aujourd’hui composée de 25 États membres et bientôt 27, de travailler d’une manière plus efficace, la Constitution pour l’Europe a amélioré, à plusieurs niveaux, le fonctionnement des institutions communautaires:
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